Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCAPHQ15003 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCAPHQ15003 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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