Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLCA4Q14CN2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CLCA4Q14CN2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCA4Q14CN2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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