Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCINQ13939 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCINQ13939 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCINQ13939 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCINQ13939 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCINQ13939 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCINQ13939 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCINQ13939 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCINQ13939 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCINQ13939 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCINQ13939 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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