Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATP1A4Q13733 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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