Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTMR3Q13615 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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