Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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