Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCGQ13326 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCGQ13326 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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