Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAA1Q13131 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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PRKAA1Q13131 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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PRKAA1Q13131 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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PRKAA1Q13131 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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PRKAA1Q13131 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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PRKAA1Q13131 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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PRKAA1Q13131 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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PRKAA1Q13131 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAA1Q13131 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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