Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TRAF3Q13114 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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TRAF3Q13114 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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TRAF3Q13114 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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TRAF3Q13114 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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TRAF3Q13114 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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TRAF3Q13114 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF3Q13114 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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