Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECH1Q13011 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECH1Q13011 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms