Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF2Q12933 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms