Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NFIAQ12857 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFIAQ12857 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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