Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 ECM8YBR076W 1065 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 TAF6YGL112C 1551 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 PRP22YER013W 3438 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YOL019WYOL019W 1656 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MET17YLR303W 1335 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 TRM11YOL124C 1302 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 HEF3YNL014W 3135 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YPR022CYPR022C 3402 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 FMP10YER182W 735 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 PCL7YIL050W 858 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 DCG1YIR030C 735 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 ARG3YJL088W 1017 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 HYM1YKL189W 1200 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YNL171CYNL171C 369 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YOL118CYOL118C 309 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MCM16YPR046W 546 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YVC1YOR087W 2028 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MNN4YKL201C 3537 nt4□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 TCA17YEL048C 459 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 ISC10YER180C 804 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YFL065CYFL065C 309 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 ERV29YGR284C 933 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 SOL3YHR163W 750 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 IRC25YLR021W 540 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 ARG80YMR042W 534 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YNR071CYNR071C 1029 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 SCD6YPR129W 1050 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 NTA1YJR062C 1374 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 PRS5YOL061W 1491 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YOL075CYOL075C 3885 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MRPL32YCR003W 552 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 HSP30YCR021C 999 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 RPS18AYDR450W 441 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 SEC53YFL045C 765 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MTM1YGR257C 1101 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 REC104YHR157W 549 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 BNA1YJR025C 534 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 GAB1YLR459W 1185 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 RAD14YMR201C 1116 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 AME1YBR211C 975 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MNR2YKL064W 2910 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YJR030CYJR030C 2238 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MYO3YKL129C 3819 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 MEK1YOR351C 1494 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 TEC1YBR083W 1461 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 RPN4YDL020C 1596 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 FLC1YPL221W 2382 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YCR085WYCR085W 354 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 RPC11YDR045C 333 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YJR038CYJR038C 363 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 BAT2YJR148W 1131 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 YAR070CYAR070C 300 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 RUF21RUF21 707 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 ARA1YBR149W 1035 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC39Q12745 HOM2YDR158W 1098 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 SPC19YDR201W 498 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 BUD26YDR241W 288 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 YGL074CYGL074C 327 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 GEP4YHR100C 558 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 CAB2YIL083C 1098 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 RRG9YNL213C 645 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 YPL168WYPL168W 1293 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 MRP2YPR166C 348 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 FLO10YKR102W 3510 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 SPC105YGL093W 2754 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 API2YDR525W 330 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 BUD25YER014C-A 462 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 SDS3YIL084C 984 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 NRK1YNL129W 723 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 HSH49YOR319W 642 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 RPS11BYBR048W 471 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 CSH1YBR161W 1131 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 BMS1YPL217C 3552 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 MSK1YNL073W 1731 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 VPS27YNR006W 1869 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 FAD1YDL045C 921 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 CWC2YDL209C 1020 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 ALB1YJL122W 528 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 MTR2YKL186C 555 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 MED11YMR112C 396 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 ACA1YER045C 1470 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 FKH2YNL068C 2589 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 MRPL11YDL202W 750 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 YDL228CYDL228C 642 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC39Q12745 YOS1YER074W-A 258 nt3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms