Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	TMA16	YOR252W	537 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YOR314W	YOR314W	330 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	BMT2	YBR141C	1014 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SPB4	YFL002C	1821 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	ALG1	YBR110W	1350 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YDL241W	YDL241W	372 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	DPB4	YDR121W	591 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	TMA19	YKL056C	504 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	TIR2	YOR010C	756 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	KTR6	YPL053C	1341 nt		3.36	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	snR63	snR63	255 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	GRX6	YDL010W	696 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RPA14	YDR156W	414 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	CLC1	YGR167W	702 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	ASI2	YNL159C	870 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YNL181W	YNL181W	1224 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YOL024W	YOL024W	519 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	HRT1	YOL133W	366 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SAS5	YOR213C	747 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YSP2	YDR326C	4317 nt		3.35	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	PGS1	YCL004W	1566 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SLA1	YBL007C	3735 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YCL075W	YCL075W	441 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	MSS2	YDL107W	1056 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	DET1	YDR051C	1005 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YHP1	YDR451C	1062 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YGR149W	YGR149W	1299 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	OKP1	YGR179C	1221 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YHR173C	YHR173C	339 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	HRT3	YLR097C	1035 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	MCK1	YNL307C	1128 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RIB5	YBR256C	717 nt		3.34	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.34	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	STU2	YLR045C	2667 nt		3.34	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	PSF1	YDR013W	627 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	PEX21	YGR239C	867 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YAL065C	YAL065C	387 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	FLD1	YLR404W	858 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	OST6	YML019W	999 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	PSF3	YOL146W	585 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	TMC1	YOR052C	453 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	DIB1	YPR082C	432 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YSA1	YBR111C	696 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ROM1	YGR070W	3468 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	VPS27	YNR006W	1869 nt		3.33	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	URC2	YDR520C	2319 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	BUD6	YLR319C	2367 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	PEX10	YDR265W	1014 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YHL045W	YHL045W	348 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	BET1	YIL004C	429 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YJL028W	YJL028W	336 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	COX19	YLL018C-A	297 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	RAD10	YML095C	633 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	RPL13B	YMR142C	600 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	MVD1	YNR043W	1191 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	SPN1	YPR133C	1233 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	MRPL37	YBR268W	318 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	TDA3	YHR009C	1572 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ACK1	YDL203C	1872 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	UTP25	YIL091C	2166 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	POL2	YNL262W	6669 nt		3.32	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	AIM14	YGL160W	1713 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	POL31	YJR006W	1464 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	PRP3	YDR473C	1410 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	NEM1	YHR004C	1341 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	PHD1	YKL043W	1101 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	UTP11	YKL099C	753 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	BLS1	YLR408C	369 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YBL010C	YBL010C	843 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YBL094C	YBL094C	333 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	CPR8	YNR028W	927 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YOR238W	YOR238W	912 nt		3.31	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	MSW1	YDR268W	1140 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	SAY1	YGR263C	1275 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	COS8	YHL048W	1146 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	SSO2	YMR183C	888 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	CMD1	YBR109C	444 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	UBP12	YJL197W	3765 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	MAL12	YGR292W	1755 nt		3.3	□□□□□ -1.88

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