Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGM3Q08188 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGM3Q08188 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms