Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDK18Q07002 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms