Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX8Q06710 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms