Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALD1Q05682 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CALD1Q05682 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms