Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUCB1Q02818 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUCB1Q02818 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUCB1Q02818 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms