Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNT1Q02742 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms