Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUD4Q01804 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUD4Q01804 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms