Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDLBPQ00341 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDLBPQ00341 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms