Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11AP98196 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP11AP98196 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms