Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNB1P98172 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNB1P98172 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms