Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBP5P82980 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBP5P82980 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBP5P82980 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBP5P82980 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBP5P82980 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP5P82980 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP5P82980 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBP5P82980 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBP5P82980 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP5P82980 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP5P82980 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP5P82980 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBP5P82980 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms