Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN10P78369 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN10P78369 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms