Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL39P62891 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL39P62891 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL39P62891 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P62891 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P62891 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL39P62891 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms