Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2LP62875 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms