Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCS1P62166 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCS1P62166 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCS1P62166 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCS1P62166 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCS1P62166 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NCS1P62166 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NCS1P62166 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCS1P62166 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCS1P62166 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms