Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS3AP61247 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS3AP61247 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms