Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNAP25P60880 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNAP25P60880 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms