Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCCD1P59942 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCCD1P59942 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms