Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP6P59044 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP6P59044 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms