Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEFSECP57772 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEFSECP57772 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms