Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN2P57739 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms