Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP1P56182 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP1P56182 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP1P56182 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP1P56182 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP1P56182 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP1P56182 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP1P56182 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP1P56182 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP1P56182 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP1P56182 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP1P56182 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP1P56182 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP1P56182 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
RRP1P56182 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP1P56182 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms