Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAX9P55771 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAX9P55771 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX9P55771 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX9P55771 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX9P55771 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAX9P55771 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAX9P55771 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAX9P55771 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAX9P55771 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAX9P55771 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX9P55771 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX9P55771 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX9P55771 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX9P55771 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX9P55771 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX9P55771 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAX9P55771 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms