Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP9P55211 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP9P55211 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP9P55211 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP9P55211 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP9P55211 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP9P55211 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms