Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NAP1L1P55209 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms