Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRPF1P55201 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRPF1P55201 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms