Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF10P55107 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF10P55107 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF10P55107 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF10P55107 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF10P55107 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF10P55107 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF10P55107 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF10P55107 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF10P55107 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF10P55107 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF10P55107 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF10P55107 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF10P55107 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms