Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHBP55084 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHBP55084 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHBP55084 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHBP55084 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHBP55084 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHBP55084 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHBP55084 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HADHBP55084 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HADHBP55084 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HADHBP55084 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HADHBP55084 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HADHBP55084 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HADHBP55084 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHBP55084 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHBP55084 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHBP55084 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HADHBP55084 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HADHBP55084 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms