Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GEMP55040 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GEMP55040 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GEMP55040 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEMP55040 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEMP55040 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEMP55040 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEMP55040 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEMP55040 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEMP55040 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GEMP55040 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GEMP55040 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GEMP55040 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GEMP55040 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEMP55040 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GEMP55040 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms