Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPAP53621 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPAP53621 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPAP53621 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPAP53621 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPAP53621 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPAP53621 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPAP53621 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms