Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PGGT1BP53609 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PGGT1BP53609 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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PGGT1BP53609 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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