Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSBP53539 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSBP53539 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSBP53539 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSBP53539 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSBP53539 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSBP53539 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSBP53539 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOSBP53539 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOSBP53539 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOSBP53539 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOSBP53539 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms