Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SMARCA4P51532 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SMARCA4P51532 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms