Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VEGFBP49765 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VEGFBP49765 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms