Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1EP49674 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1EP49674 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1EP49674 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1EP49674 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1EP49674 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1EP49674 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1EP49674 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1EP49674 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1EP49674 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1EP49674 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK1EP49674 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK1EP49674 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSNK1EP49674 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK1EP49674 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK1EP49674 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1EP49674 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms