Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC34P49427 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC34P49427 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC34P49427 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms